内科
- 心内一科
- 心内二科
- 心内三科
- 血液内科（设：造血干细胞移植病区）
- 呼吸与危重症医学科一科
- 呼吸与危重症医学科二科
- 消化内科
- 内分泌代谢科
- 肾内科（设：血液净化室）
- 风湿免疫科
- 感染性疾病科（设：感染性疾病ICU、发热门诊）
- 特需病区（设：国际医疗部/综合病区、研究病房）
神经内科
- 神经内一科
- 神经内二科
- 神经内三科
- 神经内四科
精神心理科
- 精神科
老年医学科
- 老年病科
全科医学科
- 全科医疗科
儿童医学部
- 儿科一区
- 儿科二区
- 儿科重症病区（PICU）
- 新生儿重症病区（NICU）/新生儿科
- 儿童保健康复区
- 急诊儿科
外科
- 普外一科（胃肠外科）
- 普外二科（肛肠外科）
- 普外三科（腹壁、疝外科）
- 普外四科（血管外科）
- 普外五科（甲状腺乳腺外科）
- 普外六科（肝脏外科）
- 普外七科（胆胰脾外科）
- 小儿外科
- 骨外一科（脊柱与骨肿瘤外科）
- 骨外二科（关节外科与运动医学科）一区
- 骨外二科（关节外科与运动医学科）二区
- 骨外三科（创伤骨科与手足显微外科）
- 泌尿外一科
- 泌尿外二科
- 心脏大血管外科
- 胸外科
- 神经外一科
- 神经外二科
- 烧伤整形外科
- 医疗美容科
妇产科与生殖医学科
- 妇科
- 产科
- 产前诊断中心
- 生殖健康与不孕不育科
眼科
- 眼科
耳鼻咽喉科
- 耳鼻咽喉科
口腔科
- 口腔科
皮肤科
- 皮肤科
中医科
- 中医科
康复医学科
- 康复医学科（设：新针理疗室）
- 高压氧室
临床营养科
- 临床营养科
肿瘤科
- 肿瘤科一科（头颈、乳腺肿瘤）
- 肿瘤科二科（腹部肿瘤）
- 肿瘤科三科（胸部肿瘤）
- 肿瘤科四科（盆腔、淋巴肿瘤）
- 肿瘤科放射治疗区
核医学科
- 核医学科
介入诊疗科
- 介入诊疗科
急危重症医学部
- 急诊医学科
- 创伤外科
- 重症医学科综合一病区（含：重症医学科综合一病区、心脏大血管外科重症病房）
- 重症医学科综合二病区（含：重症医学科综合二病区）
- 重症医学科高依赖病区（含：重症医学科高依赖病区、重症医学科重症康复病区）
- 重症医学科神经重症病区
- 急诊ICU
手术麻醉疼痛科
- 麻醉科（设：麻醉组、手术组）
- 疼痛科
老年康养中心（筹建）
药学部
- 药学部（设：药剂科、临床药学科）
医技科室
- 内镜诊疗科
- 消毒供应室
- 病理科
- 放射影像科（设：普放室、CT室、MR室）
- 超声诊疗科
- 妇产超声科
- 心电图室
- 呼吸功能检查室
- 临床检验科
- 输血科
- 精准医学检验实验室
- 湛江市新生儿筛查中心
科研业务科室
- 湛江市临床医学研究所（设：临床医学研究中心）
- 实验动物中心
- 细胞与基因治疗中心
健康体检中心
- 健康体检中心